Белоклювая гагара считается редким обитателем тундры по нескольким причинам:

• Спорадичное распространение. 3 Ареал птицы представляет собой не единое целое, а цепочку отдельных участков, заселённых этими птицами. 3 В других, казалось бы, подходящих для гнездования местах, белоклювой гагары нет. 3
• Малочисленность. 2 Одна пара птиц встречается на 100–200 квадратных километров, лишь изредка достигая 12–16 пар на 100 квадратных километров. 1
• Угрозы для популяции. 2 К ним относятся хозяйственное освоение человеком мест гнездования, беспокойство во время насиживания и выкармливания птенцов, загрязнение водоёмов, особенно нефтепродуктами. 2
• Гибель в рыболовных сетях. 34 В ряде районов Чукотки этот фактор приобретает катастрофический масштаб. 3

Белоклювая гагара занесена в Красную книгу Российской Федерации как вид третьей категории (редкий, спорадично распространённый вид). 13