Белизский Барьерный риф имеет важное значение для сохранения биоразнообразия, потому что в нём обитает четверть всех морских растений и животных. 4 По биологическому разнообразию экосистема коралловых рифов уступает только влажнотропическим лесам. 4

В заповедной зоне Белизского Барьерного рифа насчитывается 70 видов твёрдых и 36 видов мягких кораллов и 500 видов рыб. 4 В водах рифа встречаются редкие и исчезающие виды животных, такие как головастая и зелёная морские черепахи, черепаха бисса, а также ламантин и острорылый крокодил. 4

Экосистемы прибрежной зоны Белиза с 1996 года входят в список Всемирного наследия ЮНЕСКО как одни из наиболее богатых экосистем в мире. 2