Байкальский рачок эпишура считается важным звеном экосистемы озера по нескольким причинам:
- Он является фильтратором воды, очищая её. 14 За сутки рачок способен профильтровать около одного стакана воды. 3
- Служит важным звеном в пищевой цепочке. 14 Эпишура потребляет основную массу байкальских водорослей и является объектом питания для других ракообразных и пелагических рыб, например байкальского омуля, голомянки, желтокрылки. 45
- По данным учёных, эпишура изымает в течение года до трети первичной продукции водорослей — основных продуцентов органического вещества. 2
Таким образом, рачок участвует в цепи передачи энергии от фитопланктона к хищным представителям зоопланктона и рыбам. 4