Баргузинский соболь был на грани исчезновения до создания заповедника из-за хищнического бесконтрольного промысла. 4

Высокая ценность меха соболя привлекала многих охотников, что приводило к стремительному уменьшению численности популяции. 14 В среднем за границу продавалось 150–200 тысяч шкурок соболя в год. 4

Кроме того, на популяцию негативно повлияли:

• Вырубка лесов для сельского хозяйства и промышленного развития. 1 Это привело к сокращению ареала обитания соболя и уменьшению доступных ресурсов, таких как пища и укрытие. 1
• Экологические изменения. 1 Потепление и изменения в режимах осадков привели к снижению численности мелких млекопитающих, которые были основным источником питания соболя. 1
• Увеличение частоты лесных пожаров и изменение структуры лесных массивов. 1 Соболь требовал определённых условий для жизни и размножения, которые становились всё более труднодоступными. 1

К 1915 году в баргузинской тайге оставалось около 30–40 особей соболя. 4