Бактерии-хемотрофы считаются важной составляющей экосистем, потому что они участвуют в круговороте веществ. 25 Разные виды таких бактерий способны использовать в качестве источника энергии разнообразные химические соединения: как неорганические (например, молекулярный водород, серу), так и органические (углеводы, жиры, белки, парафины и более простые органические соединения). 13

Например, бактерии-хемотрофы участвуют в круговороте серы, азота, железа и других химических элементов. 5 Также они уничтожают в природе ядовитые вещества: аммиак и сероводород. 5

Кроме того, в некоторых водных (глубоководных океанических) экосистемах бактерии-хемотрофы являются единственными продуцентами, так как в разломах Срединно-океанических хребтов выходят воды, богатые разнообразными сложными неорганическими соединениями. 1 Они служат источником энергии для хемотрофных бактерий, а за ними, по пищевой цепи, и всей экосистемы. 1