Бактерии группы протея считаются важными показателями загрязнения окружающей среды по нескольким причинам:

• Индикация фекального загрязнения. 13 Присутствие бактерий рода Proteus в почве или воде указывает на фекальное загрязнение, что создаёт угрозу отравления при употреблении загрязнённой воды или морепродуктов. 13
• Показатель загрязнения органическими веществами. 4 Например, Proteus vulgaris чаще обнаруживают в гниющих остатках, поэтому его рассматривают как показатель загрязнения объекта органическими веществами. 4
• Выявление порчи пищевых продуктов. 5 Анализ на присутствие протея проводят при санитарно-микробиологическом исследовании пищевых продуктов для выявления их порчи. 5
• Оценка санитарного состояния. 5 Определение протея используют для оценки санитарного состояния водоёмов в местах сброса сточных вод пищевой промышленности, санитарного состояния почв при загрязнении их органическими отходами. 5

Таким образом, присутствие протеев в воде, пищевых продуктах, смывах свидетельствует о загрязнении объекта разлагающимися субстратами и о крайне неблагополучном санитарном состоянии. 4