Однозначного ответа на вопрос о том, почему Азовское море считается одним из самых чистых в России, нет.

Некоторые факторы, которые могут влиять на чистоту воды в Азовском море:

• Отсутствие крупных промышленных городов, портов и предприятий вблизи береговой линии, например в районе от станицы Голубицкая до посёлка Ильич. 2 Это благотворно влияет на местную экосистему. 2
• Низкий уровень солёности воды Азовского моря по сравнению с океаном и многими другими морями. 14 Вода Азовского моря практически безвредна при кратковременном утолении жажды. 1
• Наличие мест, где вода отличается особой прозрачностью и чистотой, например в Ейском районе вблизи станицы Должанская, у основания косы Долгой. 5 Эта территория является заповедной зоной Краснодарского края, здесь нет ни одного промышленного предприятия или завода. 5

Однако есть и факторы, которые делают воду в Азовском море менее прозрачной: поступление большого количества мутных речных вод, быстрое взмучивание донных илов при волнении моря, наличие значительных масс планктона. 1