Азиатский бурундук считается исчезающим видом по нескольким причинам:

• Сокращение площади пригодных местообитаний. 1 Это происходит из-за вырубки старовозрастных пихтово-еловых лесов и проведения в них лесохозяйственных мероприятий, приводящих к уничтожению убежищ (уборка валежника, бурелома, вырубка дуплистых деревьев). 1
• Добыча зверьков человеком. 1 В прошлом на численности вида, вероятно, отрицательно сказывалась охота. 1
• Влияние хищников. 1 К ним относятся лесная куница, горностай, лесной хорь, лисица, ястреб-тетеревятник и другие. 1

Азиатский бурундук занесён в Красные книги Нижегородской области, Республики Марий Эл, Республики Татарстан и Республики Чувашия. 2