Амударья считается одной из самых мутных рек в мире из-за большого количества наносов, которые она транспортирует. 14

В одном кубометре воды реки содержится до 3 килограммов наносов, а в дни разлива их количество увеличивается до 5–7 килограммов. 4

Несколько причин высокой мутности Амударьи:

• Русло сложено слабыми мелкопесчаными грунтами. 1 Из-за больших скоростей течения и значительных продольных уклонов грунт подвержен постоянным глубинным боковым деформациям. 1
• Значительную часть стока в низовьях реки составляют возвратные воды с орошаемых полей. 2 Они обусловили засоление речных вод и рост их минерализации, а также загрязнение ядохимикатами и другими вредными веществами. 2