Акватория Рас-Мохаммеда считается самым чистым и прозрачным морем в Египте благодаря тому, что в Красное море не впадает ни одна река. 24

Учёные считают, что 90% пластика, разного мусора и грязи в моря попадает с потоками воды из рек. 2 Помимо этого реки приносят с собой ил и песок. 2 Так как в Красном море такой фактор отсутствует, вода в нём всегда остаётся кристально чистой и прозрачной. 2

Кроме того, в бухтах национального парка Рас-Мохаммед благодаря благоприятным условиям вода сохраняет свою чистоту и прозрачность, ил за счёт водных потоков оседает на кораллах в минимальном количестве. 5