Каковы преимущества и недостатки поездов с вагонами разной вместимости?

Возможно, имелись в виду, например, двухэтажные поезда с вагонами разной вместимости.

Преимущества:

• возможность перевозки большего количества людей за меньшее время в пути; zhd.online
• за счёт большей вместимости каждого вагона цена билета может быть ниже, чем на аналогичный одноэтажный поезд; travel-russia.livejournal.com zhd.online
• при грамотном расположении окон пассажиры на втором этаже имеют лучший обзор. ru.wikipedia.org

Недостатки:

• более медленный процесс посадки и высадки пассажиров из-за необходимости прохода по лестницам; ru.wikipedia.org
• меньше мест для багажа, низкие потолки; ru.wikipedia.org
• в случае катастроф такие вагоны потенциально опаснее (больше времени на эвакуацию, большее количество потенциальных жертв); ru.wikipedia.org
• конструкция вагона усложняется, в частности, обычно требуется изогнутая хребтовая балка, а также усложняется компоновка электрооборудования. ru.wikipedia.org

Таким образом, выбор поезда с вагонами разной вместимости зависит от индивидуальных предпочтений и потребностей пассажиров.