Некоторые особенности строительства Северомуйского тоннеля:

• Работа в сложных геологических и гидрологических условиях. 4 По трассе тоннеля было выявлено четыре тектонических разлома шириной от 5 до 900 метров. 4 Приток воды из этих разломов доходил до нескольких сотен кубометров в час при гидростатическом давлении до 34 атмосфер. 4 Часто поступала термальная вода повышенной температуры, что потребовало разработки технологий её заморозки. 4
• Использование химического способа укрепления рыхлых пород. 1 В пробуренные скважины двумя потоками заливали жидкое стекло, бетон и химические добавки, которые, застыв, образовывали вокруг выработки подобие жёсткого скафандра. 1
• Многослойная конструкция стен тоннеля. 12 В наиболее сейсмоопасных местах стены делали трёх- и даже четырёхслойными: черновой бетон, армированный металлическими анкерами, сборное тюбинговое покрытие, дополнительный слой железобетона, а в Ангараканском разломе, чтобы полностью исключить поступление воды, ещё и финальный слой металлоизоляции. 1
• Использование автоматизированной системы управления технологическим процессом. 3 Инженерные системы тоннеля управляются автоматизированной системой, разработанной в Конструкторско-технологическом институте вычислительной техники СО РАН. 45
• Установка специальных ворот на порталах. 14 На обоих порталах тоннеля установили специальные ворота, которые открываются только для прохождения поезда. 14