Некоторые особенности режима Москвы-реки:

• Преимущественно снеговое питание (61% годового стока), грунтовое и дождевое составляют соответственно 27% и 12%. 12
• Половодье начинается в марте–апреле и завершается в апреле–мае. 12 За весеннее половодье проходит 65% годового стока. 1
• Замерзает в ноябре–декабре, вскрывается в конце марта–апреле. 15 Между Москвой и Коломной с конца 1970-х — начала 80-х годов ледостав неустойчив из-за сброса в реку тёплых вод. 12
• Скорость течения зависит от работы гидроузлов: при закрытых затворах — 0,1–0,2 м/с, при открытых — 1,5–2 м/с. 5
• Прозрачность воды меняется от 2 метров зимой (в январе/феврале) до 1 метра весной (в мае), летом и осенью составляя около 1,5 метра. 5
• Судоходна на 210 км от устья, до Рублёвской плотины. 5 Навигация обычно продолжается с середины апреля до середины ноября (прогулочная — до конца октября). 5