Основные задачи Управления «М» ФСБ:

• обеспечение законности при обработке сообщений о преступлениях, возбуждении уголовных дел, производстве предварительного расследования, а также защита прав и свобод человека и гражданина; 1
• оперативное и качественное расследование преступлений; 1
• осуществление инспекций правоохранительных органов; 1
• осуществление антикоррупционных мероприятий и профилактика коррупции. 1

Некоторые функции Управления «М» ФСБ:

• проведение мероприятий разведывательного характера, то есть внедрение в силовые структуры и вооружённые силы; 23
• сбор оперативно значимой информации для следственных и оперативных подразделений ФСБ; 23
• передача значимой информации о каких-либо преступлениях, взятках и коррупции. 23

Кроме того, управление «М» оказывает существенное влияние на назначения и увольнения сотрудников различных силовых ведомств, а также судов. 23