Основные водные ресурсы пустыни Каракумы в Туркменистане включают доли четырёх трансграничных рек: Амударьи, Мургаба, Теджена и Атрека. 3 Почти 90% водоснабжения страны обеспечивает Амударья. 3
Для использования в пустыне пригодны следующие виды водных ресурсов: 2
Система ирригации в пустыне Каракумы представлена, в частности, Каракумским каналом. 1 Он доставляет воду из Амударьи в южные районы пустыни. 1 Строительство канала было начато в 1954 году и завершено в 1958 году. 1 Длина канала — 1375 км, ежегодно он переносит от 13 до 20 км³ воды. 1
Также в пустыне есть коллекторы, которые используются для откачки сточных вод с орошаемых хлопковых полей, например, Дашогузский коллектор (протяжённость — 432 км) и Великий туркменский коллектор (длина — 720 км). 1