Основные функции Карельской таможни в сфере таможенного контроля:

• осуществление таможенного оформления и контроля на территории подведомственного региона; 1
• применение таможенно-тарифного и налогового механизма в части налогов, относящихся к товарам, перемещаемых через таможенную границу РФ; 1
• взимание таможенных платежей; 1
• осуществление валютного контроля; 1
• ведение таможенной статистики и анализа; 1
• пресечение нарушений таможенного законодательства. 1

Кроме того, с 1 сентября 2020 года таможенные посты Карельской таможни проводят фактический таможенный контроль, в том числе таможенные досмотры, таможенные наблюдения, таможенные осмотры помещений и территорий. 34