Борьба с фитоплазмой пролиферации яблони затруднена, так как возбудитель заболевания является внутриклеточным паразитом, а оздоровление заражённых растений невозможно. 45

Некоторые методы борьбы с болезнью:

• Использование здорового посадочного материала. 5 Необходимо проводить фитосанитарный контроль, особенно импортного, который может включать визуальный осмотр и молекулярные методы исследования (ПЦР, секвенирование участков генома фитоплазм). 2
• Выращивание устойчивых сортов. 25
• Удаление сорняков и насекомых-вредителей, которые распространяют болезнь. 4 Для борьбы с насекомыми используют зарегистрированные для этой цели инсектициды. 4
• Удаление и уничтожение поражённых деревьев. 4

Исследования на выявление фитоплазмы пролиферации яблони проводят в конце лета — начале осени, когда содержание фитоплазмы наиболее высоко в надземных органах растения, а также в начале весны до распускания почек. 2