Естественными врагами сибирского горного козла являются волк, бурый медведь и снежный барс. 3
По мнению зоологов, зимой эти хищники нападают на старых козлов, ослабевших после гона, а летом — на молодняк. 1 На маленьких козлят также нападают крупные хищные птицы, прежде всего беркуты. 1
Кроме того, значительный урон поголовью козлов наносят снежные лавины и бескормица в некоторые годы, например, из-за гололёда. 12