Экологическое состояние бассейна реки Анадырь в целом удовлетворительное. 1 Локальное загрязнение вод в основном связано с добычей полезных ископаемых (угля и особенно россыпного золота вдоль русел рек). 1
Берега Анадыря населены мало, крупнейший одноимённый город расположен уже возле океана, поэтому экологическая обстановка на водном объекте в основном благоприятная. 2