Роль простейших в глобальных экологических процессах заключается в следующем:

• Участие в круговороте веществ. 1 Простейшие, заглатывая и переваривая бактерии, ускоряют процесс обновления состава бактериального населения. 1
• Очистка водоёмов. 34 Простейшие питаются бактериями и разложившимися органическими остатками, в результате чего очищают водоёмы от загрязнений. 34
• Обеспечение питания для мелких животных. 34 Одноклеточными организмами питаются многие моллюски, ракообразные, черви, личинки, мальки рыб, водные насекомые. 3
• Индикация экологического состояния водоёмов. 2 Простейших используют как индикатор для определения степени загрязнения водоёмов, так как конкретные их виды обитают в воде при определённой концентрации органических веществ. 1
• Участие в почвообразовании. 34 Вместе с другими почвенными обитателями одноклеточные организмы обеспечивают поддержание плодородности почвы и принимают участие в почвообразовании. 3
• Участие в формировании горных пород. 34 Остатки простейших, например фораминиферов, входят в состав известняков, которые являются важным строительным материалом. 34