Основной окрас ягуара варьируется от песочного до яркой рыжеватой охры. 1

Туловище покрыто тёмными пятнами, которые у разных особей могут быть мельче и крупнее, иметь сплошной или розеточный окрас. 2 У некоторых экземпляров рисунок представлен в виде колец. 2 Морда ягуара усыпана мелкими тёмными крапинами, ярко выделяющимися на общем более светлом фоне. 2 Уши животного тёмного оттенка со светлым пятном посередине. 2 Снизу туловище ягуара светло-серого, почти белого цвета. 2

Также встречаются ягуары чёрного цвета (меланисты). 24 Это обусловлено наличием у хищника гена пантеры. 2