Тобол имеет следующее значение для речной системы Иртыша:

• Является самым полноводным притоком Иртыша. 3 В его бассейне около 20 тысяч озёр, которые составляют основу для всей экосистемы Северного Казахстана и ближайших к нему областей Южной Сибири. 24
• Воды реки и её притоков используются для водоснабжения и орошения. 1 Например, от Тобола зависит система орошения полей на десятки километров вокруг. 2
• На участке в границах Тюменской области Тобол судоходен. 3 По реке осуществляется сплав леса, транспортировка грузов и пр.. 3
• Река богата рыбой. 3 В её бассейне водятся окунь, щука, плотва, язь, голец, пескарь, ёрш, судак, лещ, карась, карп. 3 Нижний участок Тобола наиболее интересен для рыбалки: здесь, кроме прочих, водятся и ценные виды рыб, такие как стерлядь, муксун, нельма, сибирский осётр. 3