Подземные воды имеют большое значение в экосистеме пустыни Сахара. 15

Поскольку поверхностных вод в Сахаре почти нет, подземные воды служат источником водоснабжения, от близости которых зависит существование людей, животных и растений. 1

Благодаря подземным водам в Сахаре образуются оазисы — участки с богатой растительностью. 5 В окраинных частях пустыни и некоторых горных районах есть озёра с чистой водой, которые питаются подземными водами. 1

Также подземные воды используются для ирригации, например, в рамках ливийского проекта «Великая рукотворная река». 24

Однако с подъёмом уровня грунтовых вод часто связано избыточное засоление и появление солончаков. 1