Река Шингу имеет важное значение для экосистемы Амазонии. 1 Она является частью сложной экосистемы, которая поддерживает крупнейшие в мире дождевые леса и большое разнообразие культур. 1

В верхнем течении реки по обоим берегам находятся сухие тропические леса Мату-Гросу, ниже по течению левый берег занимают влажные леса Тапажоса-Шингу, а правый — влажные леса Шингу-Токантинса-Арагуаи. 5

Кроме того, на протяжении многих столетий Шингу кормила индейцев, несколько племён продолжают жить на её берегах до сих пор. 4 В конце 1950-х годов правительство Бразилии организовало на берегах Шингу первый в стране индейский парк, где проживает 14 индейских племён, ведущие практически такой же образ жизни, что и их предки. 4