Озеро Малави (Ньяса) имеет важное значение в экосистеме Восточной Африки по нескольким причинам:

• Разнообразие видов. 12 В озере обитает свыше 1000 видов рыб, большая часть из которых — эндемики. 2 Благодаря особенностям формирования озеро долгое время было замкнутой системой, поэтому эволюция здесь проходила в отрыве от других водных систем. 2
• База для рыболовства. 13 Цихлиды, обитающие в озере, являются основой для рыболовства и обеспечивают питанием значительную часть населения Малави. 13
• Место обитания других животных. 13 Кроме рыб, для озёрной экосистемы характерно большое количество крокодилов, а также африканских орланов-крикунов, которые охотятся на рыбу. 13
• Влияние на климат. 2 Уровень воды в озере снижается из-за испарения, что негативно влияет на климат всей области, окружающей водоём. 2
• Важность для экономики. 5 Стоки из озера Малави в реку Шире жизненно важны для экономики, поскольку водные ресурсы поддерживают гидроэнергетику, ирригацию и биоразнообразие ниже по течению. 5