Озеро Хубсугул имеет важное значение в экосистеме Монголии как нетронутый уголок дикой природы. 12 Здесь обитает множество животных и птиц, занесённых в Международную Красную Книгу. 1 Например, дикие северные олени, лось, лисицы, глухари, серые цапли и лебеди. 1

Хубсугул — это огромный резервуар чистой питьевой воды. 1 В нём сосредоточено около 1–2% мирового запаса пресной воды. 1

Район озера является национальным парком, который строго охраняется. 3 Он служит переходной зоной между центральноазиатской степью и сибирской тайгой. 3

Благодаря уникальности озера Хубсугул включили во Всемирную сеть биосферных заповедников ЮНЕСКО. 4