Озеро Балхаш имеет важное значение для экологии региона, так как играет роль главного природного регулятора баланса в бассейне реки Балхаш-Алаколь. 5

Некоторые аспекты влияния озера на экологию:

• Разнообразие экосистемы. 2 Сочетание пресной и солёной воды создаёт уникальные условия для флоры и фауны. 2 В озере обитают различные виды рыб, в том числе редкая и находящаяся под угрозой исчезновения рыба — муксун. 2 Также оно служит местом обитания для более 200 видов птиц. 2
• Роль в водном цикле. 1 Озеро — естественный испаритель в аридной зоне, что важно для поддержания водного баланса. 1
• Значение для экономики и населения региона. 1 Озеро служит источником водных ресурсов, объектом для развития рыбоводства, пастбищно-сенокосных угодий, земледелия и туризма. 1

Однако экосистема озера Балхаш находится под угрозой. 2 Основные факторы, влияющие на ухудшение состояния озера: промышленное загрязнение, климатические изменения, проектирование и реализация ирригационных систем, рыболовство. 2