Озеро Аслыкуль имеет большое значение для местной флоры и фауны. 14

Растительность озера представлена камышом, рогозом и тростником обыкновенным. 1 В окрестностях озера колки липово-дубово-берёзовых лесов сочетаются с участками типчаково-ковыльных степей, а также солончаковыми лугами вдоль побережья. 1

Озеро и его окрестности привлекают для гнездовья, а также отдыха и прокорма во время осенних и весенних перелётов различные виды птиц: уток, лебедей, гусей, пеганок и других. 1

Территория озера обладает богатым животным и растительным миром. 1 Здесь произрастают растения, занесённые в Красную книгу Российской Федерации. 1 Из видов животных, включённых в Красную книгу, обитают обыкновенный аполлон, степная дыбка, чернозобая европейская гагара, казарка краснозобая, сапсан. 1

Осенью и весной Аслыкуль становится пристанищем для мигрирующих водоплавающих птиц. 1 На пролёте останавливаются около 25 видов, а гнездятся свыше 100 видов птиц. 1

Ихтиофауна озера представлена различными видами рыб: плотва, щука, окунь, судак, налим, карп, сазан, линь, а также сиг, рипус, и даже встречается морская рыба-игла. 1