Значение Ненецкого заповедника для сохранения биоразнообразия заключается в том, что он изолирован от любой человеческой деятельности, угрожающей экосистемам Арктики. 1 Это гарантирует, что территория останется свободной от негативного влияния человека, и экосистемы смогут функционировать бесперебойно. 1

Некоторые другие аспекты, которые способствуют сохранению биоразнообразия:

• Изобилие водно-болотной растительности. 2 Территория заповедника привлекает тысячи птиц, так как здесь проходит Восточно-Атлантический миграционный путь птиц, которые гнездятся в восточно-европейских и западносибирских тундрах и зимуют в странах Западной Европы. 2
• Наличие крупных мест размножения Атлантического моржа. 3
• Защита источников важных ресурсов. 1 На территории заповедника расположено огромное количество источников пресной воды, которая нужна для всего живого. 1 Эти источники могут быть под угрозой из-за деятельности человека, и их защита имеет первостепенное значение. 1
• Проведение научных исследований и экомониторинга. 1 Заповедник сотрудничает с научными институтами страны и зарубежными партнёрами, предоставляя им возможность наблюдать за природой Арктики в охраняемом пространстве. 1 Информация, которую они получают, важна для охраны природы. 1