Хребет Черского имеет важное значение для экологии и биоразнообразия северо-восточной Сибири. 14

Горно-озерная область в южной части хребта — один из объектов природного наследия дальневосточного Севера. 24 Здесь сохранились первозданные ландшафты и уникальное биоразнообразие. 24

Территория хребта важна для сохранения разнообразия растений и животных верхнеколымского бассейна. 1 В составе флоры выявлено множество реликтовых и эндемичных видов растений. 5 Для животного мира характерны, например, бурый медведь, лось, северный олень, кабарга, рысь, соболь, горностай, белка, заяц-беляк, ондатра, каменный глухарь, белая куропатка, кедровка. 3

Озеро-речная сеть горных районов верховьев Колымы и южных отрогов хребта Черского определяет значение территории для охраны водных растений и животных. 1

Кроме того, территория хребта находится на границе Арктической зоны РФ и может служить уникальной точкой мониторинга динамики биологического разнообразия и миграции видов в условиях меняющегося климата. 1