Архипелаг Чагос имеет важное значение для морской экологии по нескольким причинам:

• Сохранение биоразнообразия. 1 В этом районе обитает 220 видов кораллов, в том числе разновидность мозгового коралла, который считается эндемиком атолла. 1 Также архипелаг является убежищем для многих видов рыб, включая мантов, акул и тунца. 1
• Место гнездования черепах. 1 Острова архипелага важны для гнездования зелёных и ястребиных черепах, популяции которых имеют международное значение. 1
• Естественная лаборатория для изучения экосистем. 1 Архипелаг Чагос обеспечивает важный ориентир для сохранения кораллов и позволяет изучать функционирование сложных экосистем. 1
• Влияние на регенерацию коралловых рифов. 2 Британские экологи выяснили, что очистка тропических океанических островов от популяций крыс, случайно завезённых человеком, может ускорить регенерацию коралловых рифов. 2

Архипелаг Чагос находится в одной из крупнейших морских охраняемых территорий на планете, что защищает его от промышленных рыболовных судов и других видов деятельности, которые могут нанести вред прибрежной среде. 3