Восточно-Африканская рифтовая система оказала значительное влияние на формирование озёр Танганьика и Ньяса. 15

Эти озёра имеют тектоническое происхождение и образовались в результате заполнения водами крупных тектонических трещин, которые возникли вдоль Восточно-Африканского рифтового разлома. 1

Форма озёрной котловины каждого из них повторяет конфигурацию геологических структур. 1 Как правило, озёра располагаются в сбросовых впадинах (грабенах) в ряд, одно за другим, образуя длинные цепочки или гирлянды. 5

Кроме того, рифтовые впадины заполнены мощными толщами речных и озёрных отложений, отчасти лавами и вулканическими туфами. 2