Горы Атлас оказывают следующее влияние на климат и флору прилегающих территорий:

Климат: на севере климат субтропический средиземноморский, во внутренних и южных районах — полупустынный. 3 Горные хребты преграждают влажным воздушным массам доступ во внутренние районы, и осадков там выпадает менее 500 мм. 2 В районах высокогорья снег может лежать до 5 месяцев, максимальная высота снежного покрова — до 2 метров. 1

Флора: на побережье и в нижних частях склонов на коричневых почвах распространены вечнозелёные кустарниковые заросли, рощи карликовой пальмы, леса из вечнозелёного пробкового дуба. 2 Выше 1500 м вечнозелёные леса уступают место листопадным из среднеевропейских широколиственных пород. 2 Во внутренних сухих областях и на юге, в зоне субтропических пустынь, — разреженная злаковая растительность (ковыль, альфа), полыни. 3 Выше 3000 м в горах встречаются сравнительно редкие участки альпийских лугов. 2 Вершины самых высоких хребтов лишены растительности и большую часть года покрыты снегом. 2