Горы Анды оказывают следующее влияние на климат и природу Патагонии:

• На климат. Побережье и западные склоны гор находятся под постоянным воздействием сильных западных ветров, приносящих огромное количество осадков. 2 На восточном склоне, подветренном по отношению к западным воздушным течениям, количество осадков резко снижается. 2
• На растительность. Склоны Патагонских Анд покрывают влаголюбивые субантарктические леса, состоящие из высокоствольных деревьев и кустарников, среди которых преобладают вечнозелёные виды. 2 С поднятием в горы леса разреживаются и видовой состав их обедняется. 2 На крайнем юге их постепенно сменяет растительность тундрового типа. 2 У подножия гор леса переходят в сухие степи и кустарниковые заросли Патагонского плато. 2
• На высотный климат. В горной зоне Патагонских Анд и Кордильер Пайне наблюдается холодный высотный климат, где не бывает выше нуля, уровень осадков в виде снега составляет 2000 мм в год, а растительность практически отсутствует. 4 Благодаря ему на высотах более 700 метров над уровнем моря в Южной Патагонии сохраняются ледники — это так называемая территория вечной мерзлоты Южной Америки. 4