Влияние вулкана Мауна-Кеа на окружающую среду заключается в следующем:

• Разнообразие экосистем. 1 Благодаря возвышенности Мауна-Кеа обладает наибольшим разнообразием биотических экосистем на Гавайском архипелаге. 1 Экосистемы горы образуют концентрические кольца вдоль её склонов из-за изменения температуры и количества осадков с высотой. 1
• Угроза для местных видов. 1 Некоторые представители уникальной фауны исчезли, а оставшиеся испытывают давление со стороны завезённых животных и растений. 3 Например, из-за развития сахарной промышленности в регионе под угрозой исчезновения находится софора золотистая. 2
• Влияние на леса. 3 Площадь леса, состоящего из золотистолистной софоры, постоянно сокращается. 3 Сейчас вся площадь лесов (212 кв. км) является заповедником. 3

Влияние на местных жителей связано с тем, что Мауна-Кеа считается священным местом, и не все гавайцы могут подниматься на вершину. 35 Многие местные жители критикуют постройку обсерватории, так как путешественники и учёные нарушают запрет на посещение вулкана и вредят его экологии, разбрасывая мусор. 5

Кроме того, подводные вулканы, подобные Мауна-Кеа, представляют собой опасность, так как затрудняют навигацию кораблям, а обвал подводной части зачастую приводит к созданию цунами. 2