Твёрдый сток оказывает следующее влияние на экосистемы водных объектов:

• Накопление загрязняющих веществ. 2 Речные наносы мелких фракций в процессе своего перемещения и отложения в русле реки накапливают весь комплекс химических элементов, присутствующих в воде. 2 Концентрация загрязняющих химических элементов в наносах размером меньше 0,020 мм (глинистые и илистые частицы) зачастую превышает их концентрацию в речной воде в 5–10 раз. 2
• Изменение донных отложений. 2 Техногенные донные отложения являются концентраторами основной массы загрязняющих водные системы веществ. 2 Результаты исследования речных донных отложений позволяют установить наиболее неблагополучные в экологическом отношении участки реки, скорректировать состав и объём мониторинга речного бассейна, выявить и нейтрализовать источники загрязнения. 2

Кроме того, речной сток определяет водный и термический режим рек и сток наносов, состояние почвенного и растительного покрова пойменной экосистемы, что играет большую роль в функционировании водных и околоводных экосистем, прежде всего, в размножении рыб и других гидробионтов. 5