Строительство плотин, в частности ГЭС, может оказывать негативное влияние на экосистему Байкала. 12 Некоторые возможные последствия:

• Изменение объёма и качества воды. 1 Например, увеличение растворённого азота из-за пропуска воды через турбины. 1 Также возможно снижение уровня воды из-за увеличения потерь на инфильтрацию и испарение. 1
• Деградация почвы. 1 Возможно оголение суши в пойме реки, иссушение и засоление верхнего плодородного слоя. 1
• Нарушение миграции живых организмов. 2 Плотины могут препятствовать миграции редких видов рыб, снижать их численность. 2
• Ухудшение условий водоснабжения. 2
• Деградация водно-болотных угодий. 2
• Аккумуляция токсичных тяжёлых металлов, в том числе ртути, что наносит ущерб здоровью людей. 2
• Выделение парниковых газов, в том числе метана, что ведёт к изменениям климата. 2
• Потеря геологической устойчивости и увеличение риска оползней, эрозии, землетрясений, а также наводнений (в случае катастрофического разрушения плотины). 2

Например, после строительства Иркутской ГЭС на Ангаре, единственной реке, вытекающей из Байкала, произошло затопление прибрежной территории, эрозия берегов, пострадали озерно-соровые водные системы, игравшие важную роль в экосистеме озера. 45