Режим реки Обь оказывает следующее влияние на окружающую среду Западной Сибири:

• Загрязнение воды. 23 В реку попадают бытовые и промышленные стоки, мусор, а также вещества с обширных заболоченных территорий Западной Сибири, в том числе с Васюганского болота. 4 Это приводит к снижению содержания растворённого в воде кислорода и заморным явлениям, когда в основном в период ледостава гибнет рыба. 4
• Трансформация почв и растительного покрова. 1 Поступление токсичных соединений приводит к деградации растительного покрова и изменению качества подземных и поверхностных вод. 1
• Изменение видового состава гидробионтов. 3 После впадения притоков и в местах расположения промышленных центров загрязнённость воды Оби увеличивается, что сказывается на видовом составе рыбы и донных отложений. 3

Однако есть и положительные аспекты влияния режима реки на окружающую среду Западной Сибири: большой объём водного стока обеспечивает физическое самоочищение, а развитая пойма — биологическое. 4