Пустыня Гоби оказывает влияние на биоразнообразие Центральной Азии, в частности, формируя обеднённые по видовому составу сообщества. 2 В таких условиях отбираются виды, наиболее адаптированные к крайне жёстким условиям произрастания. 2

Суровые климатические условия наложили отпечаток на животный мир пустыни. 13 По сравнению со Средней Азией здесь значительно реже встречаются змеи, скорпионы, фаланги и другие обычные обитатели пустынных ландшафтов. 13

Однако некоторые виды сумели приспособиться к жизни в Гоби. 5 В пустынной и полупустынной местности живут волки, гобийские медведи, сайгаки, дзерены, чернохвостые газели, дикие лошади, мелкие грызуны и другие животные. 5

Кроме того, пустыня Гоби влияет на формирование гидротермического режима и микроклимата в экосистемах. 4 Например, при зарастании пустынь растениями уменьшается отражательная способность Земли, а поглощение солнечного тепла увеличивается. 4