Муссонный климат Хоккайдо оказывает следующее влияние на флору и фауну острова:

Для флоры характерны следующие особенности:

• Разнообразие лесов. 24 Большую часть территории занимают смешанные и широколиственные леса. 2 На севере острова преобладают хвойные леса умеренного пояса, при движении на юг их сначала сменяют широколиственные леса, затем хвойные — из криптомерии японской, видов из родов кипарис и сосна. 4
• Наличие эндемиков. 4 Из-за островной изоляции сохранились такие виды, как японский кипарис, криптомерия, японская сосна и другие. 3
• Наличие видов, общих с другими регионами. 3 Для флоры характерны виды, общие с Сибирью, Восточным Китаем, Камчаткой и в какой-то мере Северной Америкой. 3

Для фауны характерны следующие особенности:

• Различия между севером и югом. 1 Это связано с климатом и историей развития Японских островов. 1
• Наличие представителей дальневосточной тайги. 1 На острове обитают бурый медведь, соболь, горностай, белка. 1
• Обитание южных животных. 1 К югу от 40° с.ш. встречаются японский макак и японский чёрный медведь. 1
• Наличие нетипичных для Японии видов. 4 Например, бурый медведь, пятнистый олень, японский журавль, сахалинский подвид обыкновенной лисицы. 4
• Наличие редких видов. 4 Рыбный филин — редкая птица, находящаяся под угрозой исчезновения. 4