Геологическое происхождение горы Аконкагуа связано со столкновением двух литосферных плит — Наска и Южно-Американской. 25

В период от позднего мела или раннего палеоцена до миоцена Аконкагуа была активным стратовулканом и состояла из нескольких вулканических комплексов. 1 Однако в миоцене, около 8–10 миллионов лет назад, угол субдукции начал уменьшаться, что привело к увеличению напряжения между океанической и континентальной плитами, вызвав разрывные толчки, которые подняли Аконкагуа наверх. 1

Геологическая структура горы может быть разделена по трём основным геологическим периодам: основание вершины сформировалось ещё до юрского периода, средняя часть вершины образовалась в мезозое, а верхняя часть сформировалась в кайнозое. 2