Некоторые животные, которых можно встретить в Баргузинском заповеднике:

• Млекопитающие: соболь, азиатская лесная мышь, белка, летяга, бурундук, средняя и крошечная бурозубка, лесной лемминг, большеухая полёвка, альпийская пищуха. 2 Также заповедник — место обитания ласки, росомахи, горностая, зайца-беляка, лисицы, волка, медведя, кабарги, благородного оленя, северного оленя, лося. 2
• Птицы: серый снегирь, щур, глухая кукушка, каменный глухарь, рябчик, кукша, желна, обыкновенный и белокрылый клёст, синехвостка, сибирская завирушка, бородатая неясыть, мохноногий сыч и другие птицы. 2
• Рептилии и амфибии: сибирский углозуб, остромордая и сибирская лягушки. 2 Из пресмыкающихся здесь обитает обыкновенный щитомордник, обыкновенная гадюка, узорчатый полоз, обыкновенный уж и живородящая ящерица. 1
• Рыбы: щука, налим, сорога, сиг, омуль, хариус, таймень. 2

Растения: в заповеднике выявлено более 870 видов сосудистых растений, 210 видов лишайников, 170 видов грибов. 2 Здесь встречаются леса (лиственничные и горно-таёжные) — с преобладанием кедров, кедровых стлаников, сосны, также есть участки с лиственницами, пихтами, берёзами и елями. 2 Большую часть территории покрывают высокогорные альпийские луга с труднопроходимыми зарослями кедрового стланика и кустарниковыми берёзняками и ивняками. 2 Есть также участки с моховыми болотами, голыми скалами и каменистыми россыпями. 2