Некоторые задачи, которые выполняет Пограничная служба ФСБ России на морских границах:

• Охрана государственных границ на морских, речных, озёрных участках и других водоёмах. 1
• Охрана биологических ресурсов, находящихся в морских пограничных пространствах России, и содействие государственному контролю в этой сфере. 1
• Борьба с контрабандой, незаконными миграциями, ввозом и вывозом наркотиков, оружия и других запрещённых грузов. 1
• Участие в акциях по борьбе с международной преступностью, терроризмом и пиратством. 1
• Поиск и спасение людей, судов и объектов, терпящих бедствие на море. 4
• Обеспечение безопасности объектов морской экономической деятельности. 4
• Контроль режима плавания по Северному морскому пути. 4
• Экологический мониторинг надводной обстановки. 4

Пограничная служба также выполняет другие задачи, возложенные на неё федеральными законами и международными договорами Российской Федерации. 35