Некоторые виды животных, которые считаются уникальными для Дарвинского заповедника:

• Орлан-белохвост. 12 Здесь отмечена наибольшая в мире плотность гнездовий этих птиц, занесённых в Красную книгу. 1
• Скопа. 14 В заповеднике наблюдается наибольшая в Европе плотность гнездовий этих редких птиц. 1
• Белка-летяга, манул, кабарга, изюбрь и кожанок. 3 Эти виды считаются редкими для Дарвинского заповедника и включены в Красную книгу. 3

Также к уникальным животным заповедника относятся лоси, кабаны, лисицы, волки и медведи. 24