В Онежском озере обитают, например, следующие виды рыб:

• Осетровые: стерлядь. 1
• Лососёвые: лосось озёрный, форель озёрная и ручьевая, палия лудная и ямная, ряпушка, ряпушка-килец, сиг. 15
• Хариусовые: хариус. 1
• Корюшковые: корюшка. 1
• Щуковые: щука. 1
• Карповые: плотва, елец (корбица, салага), густера (тарабашка, подлещик), лещ, чехонь, карась золотой. 1
• Вьюновые: голец усатый (вьюн, вьюнчик), щиповка (вьюн, вьюнчик). 1
• Сомовые: сом. 1
• Угревые: угорь. 1
• Окуневые: судак, окунь, ёрш. 1
• Бычковые: рогатка онежская (лопарь), подкаменщик пестроногий (лопарь), подкаменщик (лопарь). 1
• Колюшковые: колюшка девятииглая, колюшка трехиглая. 1
• Тресковые: налим озёрный, налим озёрно-речной. 1
• Миноговые: минога речная и минога ручьевая. 1

Всего в Онежском озере встречается 47 видов и разновидностей рыб, относящихся к 13 семействам и 34 видам (включая миног). 1