Некоторые уникальные виды флоры и фауны, которые можно встретить в Командорском заповеднике:

• Флора. На территории заповедника произрастают 158 видов водорослей и 383 вида сосудисто-волокнистой флоры, включая 37 подвидов. 1 Среди краснокнижных растений — любка камчатская, лапчатка берингийская и послушник азиатский. 1 Редким видом является башмачок Ятабе — растение из семейства орхидей, которое растёт на приморских увлажнённых склонах и по окраинам тундровых болот. 1

• Фауна. В заповеднике водятся не менее 25 видов рыб, 213 видов птиц и 25 видов млекопитающих. 1 Среди них — северный олень, американская норка, серая крыса, красная полевка. 1 Символ заповедника — медновский голубой песец, который обитает только на архипелаге. 1

Также в заповеднике имеются охраняемые крупные лежбища морских животных: сивучей и северных морских котиков. 3