Некоторые уникальные реликтовые деревья, которые растут в Дилижанском заповеднике:
- Тис ягодный. web.archive.org Типичный реликт третичного периода, отдельные деревья которого встречаются по всей территории заповедника. web.archive.org В Ахнабадском ущелье сохранилась тисовая роща, где растут прямоствольные экземпляры возрастом 300–400 лет, высотой 20 м и более (самые крупные — до 25 м) при диаметре 75–80 см. web.archive.org
- Сосна Коха. web.archive.org Также сохранилась с третичного периода, на территории заповедника есть небольшие рощицы этого дерева. web.archive.org
- Рододендрон кавказский. web.archive.org en.wikipedia.org Произрастает на юго-западе заповедника по верхней границе леса. web.archive.org
Кроме того, в заповеднике есть группа видов средиземноморского происхождения, сохранившихся с третичного периода: держидерево, фисташка туполистная, различные виды можжевельников. web.archive.org