Некоторые уникальные природные явления, которые наблюдаются в пустыне Атакама:

• Каманчака. 1 Вдоль побережья происходит густой морской туман с Тихого океана, который покрывает пустыню. 1 Несмотря на то, что каманчака не вызывает никаких дождей, она является минимальным источником влаги для некоторых растений и животных. 1
• Цветущая пустыня Атакама. 34 Раз в несколько лет или даже десятилетий эта область превращается в оазис из разнообразных цветов, которые произрастают на песчаных дюнах и в окрестностях скал. 3 Это происходит благодаря редким дождям, которые приводят к размножению цветов, а также сильным ветрам, которые переносят семена цветов из окрестностей. 3
• Залежи тёмного силикатного стекла. 2 Они сосредоточены на участках пустыни Атакама к востоку от плато Пампа-дель-Тамаругаль на севере Чили. 2 Поля тёмно-зелёного или чёрного стекла встречаются в коридоре протяжённостью около 75 километров. 2 По мнению учёных, это остатки внеземного объекта — скорее всего, кометы, которая обрушилась на Землю после взрыва и расплавила песчаную поверхность. 2