Некоторые уникальные природные особенности озера Маныч-Гудило, которые отличают его от других водоёмов:

• Высокая солёность воды. 25 Концентрация хлорида натрия в Маныч-Гудило почти вдвое превышает показатели Чёрного моря. 2
• Природный гул. 2 Он возникает при отражении от крутого берега больших волн, поднимающихся при сильных ветрах. 1
• Сложная береговая линия. 2 Она сильно изрезана, включает лиманы, крупные и мелкие заливы и периодически подтопляемые низины. 1 Северный берег озера высокий и обрывистый, южный — пологий. 1
• Наличие островов. 2 Крупнейшие из них — Водный и Птичий. 2 Ранней весной на одних островах распускается множество разноцветных тюльпанов, в том числе краснокнижных, на других весной и летом собираются большие колонии гнездящихся птиц. 4
• Расположение на одной из важнейших в Евразии миграционных трасс птиц. 1 Озеро является важным центром гнездования и миграции многих видов птиц. 1