Некоторые уникальные природные объекты, расположенные в бассейне реки Вилюй:

• Озеро Ниджили. 3 Это самое крупное природное озеро Центрально-Якутской низменности. 3 В него впадают реки Кюнкюй и Харыя-Юрях, а берёт начало речка Сиэн (бассейн реки Вилюй). 3 Озеро внесено в Перспективный список водно-болотных угодий Рамсарской конвенции. 3
• Песчаные дюны (якутские «тукулааны»). 3 Они расположены в местности «Бээриндэ». 3
• Вилюйское плато. 4 Расположено в районе посёлков Айхал и Удачный. 4 Это исток четырёх крупных рек: Вилюя, Мархи, Оленька и Ыгыаты. 4 На плато сосредоточена наибольшая мощность вечной мерзлоты во всём мире. 4
• Кимберлитовая трубка Удачная. 4 Крупнейшее в мире месторождение алмазов. 4 В ней добыли много драгоценных камней, включая кристаллы, которые сейчас находятся в Алмазном фонде. 4
• Территория Муус Аппа. 4 Здесь находятся уникальные подземные источники, которые в суровые якутские зимы не замерзают. 4
• Белоснежный утёс высотой 100 метров. 4 Он расположен неподалёку от посёлка Сунтар и представляет собой залежи соли на фоне красной глины. 4